Международная группа ученых обнаружила свыше 42 тысяч ранее не описанных разновидностей РНК-вирусов, исследовав образцы из 102 городов 31 страны. Всего специалисты составили каталог из 54 945 вирусных генетических групп, около 77 % которых не имели известных аналогов, сообщает Nature Communications.
Основой исследования стали 1862 пробы, полученные участниками консорциума MetaSUB с марта по июль 2020 года. Для сбора материала специалисты использовали поверхности, к которым часто прикасаются люди: поручни, скамейки и автоматы по продаже билетов. Дополнительно ученые привлекли архивные данные об образцах почвы, донных отложений, пресной воды, канализационных стоков и теплиц. В результате общая выборка достигла 2922 образцов.
Лабораторная обработка позволила получить более 100 млрд коротких фрагментов генетических последовательностей. После их объединения исследователи сформировали почти 300 млн более длинных участков. Для распознавания вирусного материала применили программу geNomad, разработанную при участии Антонио Педро Камарго из Университета Сан-Паулу.
Предполагаемых хозяев удалось определить примерно для трети изученных вирусных групп. Среди них чуть более половины оказались бактериофагами — вирусами, заражающими бактерии. При этом обнаружение неизвестных вирусных последовательностей само по себе не свидетельствует об угрозе для здоровья человека.
Генетический анализ также позволил предположить существование двух новых типов и одного класса РНК-вирусов. Наибольшим разнообразием отличались образцы почвы и донных отложений, а сточные воды также вошли в число наиболее богатых вирусами сред. Для уточнения результатов исследователи рекомендуют изучать больше регионов и совершенствовать методы восстановления полных вирусных геномов.
